El Biotopo Protegido Naachtún–Dos Lagunas se encuentra en el norte de Petén, dentro de las zonas núcleo de la Reserva de la Biosfera Maya. Bosque, humedales estacionales y escasas fuentes de agua dulce sostienen fauna regional, mientras los paisajes arqueológicos vecinos conservan asentamientos y calzadas mayas.
CONAP registra Dos Lagunas con 30.719 hectáreas y declaratoria de 1990. Integra un paisaje continuo con el Parque Nacional Mirador–Río Azul y bosques hacia México y Belice. Es territorio protegido remoto, no parque de día autoguiado.