Aquincum se encuentra en Óbuda, al norte del centro de Budapest, donde hubo un importante asentamiento romano cerca del Danubio. La guía del propio museo distingue la Ciudad Civil de la Ciudad Militar: esta última ocupaba el entorno de la actual plaza Flórián, mientras que la zona civil estaba a unos dos kilómetros. El parque arqueológico conserva parte de ese centro urbano; el visitante encuentra restos de una ciudad, no un monumento aislado.
Los romanos llegaron al Danubio alrededor del comienzo del siglo I. La Ciudad Civil de Aquincum evolucionó desde un asentamiento con construcciones de madera y arcilla hasta convertirse, en el siglo II, en una población planificada y edificada en piedra. Bajo el emperador Adriano probablemente obtuvo rango de municipium hacia el año 124; con Septimio Severo recibió el de colonia en 194. Son hitos de su posición administrativa, no una fecha única de fundación.