El nombre Fílae remite a dos geografías. Designa la isla y el santuario originales del Nilo, pero los templos más conocidos se encuentran hoy en la vecina isla de Agilkia, al sur de Asuán. El Ministerio de Turismo y Antigüedades de Egipto describe el conjunto como un grupo de monumentos dominado por el templo de Isis, acompañado de santuarios, puertas y columnatas. El entorno forma parte de la experiencia: la visita comienza junto al río y continúa en barco, de modo que la aproximación permite contemplar la isla antes de que aparezca el primer pilono.
El monumento principal comenzó a construirse bajo Ptolomeo II Filadelfo, que reinó entre 285 y 246 a. C., y fue consagrado a Isis, madre de Horus. Sus relieves representan episodios del nacimiento del dios y del ciclo de Isis, Osiris y Horus. El conjunto no se levantó de una sola vez. La mayoría de las construcciones corresponden al periodo ptolemaico, aunque emperadores romanos y otros gobernantes añadieron o modificaron edificios. La Academia Austriaca de Ciencias señala que el conjunto conservado abarca desde finales del siglo IV a. C. hasta el siglo II d. C., con indicios de culto anterior.